57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1261 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  100 
 
 
184 aa  374  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  79.27 
 
 
194 aa  293  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  47.5 
 
 
202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  34.84 
 
 
220 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  40.77 
 
 
221 aa  95.9  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  35.45 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  35.03 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  35.33 
 
 
267 aa  92.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  42.36 
 
 
231 aa  91.3  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  41.54 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  35.95 
 
 
267 aa  89.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  32.82 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  36.23 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  38.67 
 
 
166 aa  84.7  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  39.86 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  36.76 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  33.58 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  32.95 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  39.06 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  41.18 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  38.69 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  34.92 
 
 
151 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  34.48 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  31.9 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  30.06 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  36.43 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  31.88 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  30.13 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  31.65 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  30.94 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  30.56 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  32.45 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  29.58 
 
 
272 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  28.49 
 
 
229 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  28.49 
 
 
229 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  28.49 
 
 
229 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  25.56 
 
 
240 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  27.89 
 
 
194 aa  61.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  28.87 
 
 
227 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  28.73 
 
 
186 aa  58.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  32 
 
 
213 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  30.95 
 
 
147 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  24.16 
 
 
192 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  31.51 
 
 
165 aa  51.2  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  28.12 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  34.04 
 
 
142 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  34.52 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4249  GtrA family protein  34.52 
 
 
142 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000330424  unclonable  0.0000000113539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0464  GtrA-like protein  28.32 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611828  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  31.96 
 
 
154 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  29.63 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  29.03 
 
 
191 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0141  GtrA family protein  30.43 
 
 
141 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  29.55 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0318  GtrA family protein  30.34 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0401577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  26.9 
 
 
155 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1862  hypothetical protein  25.71 
 
 
130 aa  40.8  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>