25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0318 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0318  GtrA family protein  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401577 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0464  GtrA-like protein  74.53 
 
 		 176 aa  238  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1911  GtrA family protein  39.26 
 
 		 419 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0238992 
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  32.09 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18800  GtrA family protein  30.66 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000044791  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3936  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.52 
 
 		 397 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368189  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0793  putative GAF sensor protein  28.78 
 
 		 521 aa  52.4  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0150  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.77 
 
 		 388 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3886  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.12 
 
 		 397 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  30.14 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0778  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 414 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12213  hitchhiker  0.000342475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4178  GtrA-like protein  31.34 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.476418  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2369  putative glycosyl transferase  30.61 
 
 		 376 aa  47.8  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0197  dolichyl-phosphate beta-d-mannosyltransferase  31.58 
 
 		 413 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0265361  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30 
 
 		 384 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  29.81 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2450  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.06 
 
 		 376 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  22.6 
 
 		 432 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0022  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 		 412 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  21.83 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1427  GtrA family protein  36.23 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  22.22 
 
 		 272 aa  41.2  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0421  GtrA family protein  35.53 
 
 		 184 aa  40.8  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1615  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  22.15 
 
 		 359 aa  40.4  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  24.82 
 
 		 127 aa  40.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>