30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0464 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0464  GtrA-like protein  100 
 
 		 176 aa  361  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0318  GtrA family protein  74.53 
 
 		 162 aa  238  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0793  putative GAF sensor protein  30.77 
 
 		 521 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1911  GtrA family protein  32.33 
 
 		 419 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0238992 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18800  GtrA family protein  32.35 
 
 		 130 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000044791  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0197  dolichyl-phosphate beta-d-mannosyltransferase  33.08 
 
 		 413 aa  53.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0265361  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  28.28 
 
 		 272 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  28.97 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  28.97 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  28.97 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  28.97 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  27.89 
 
 		 240 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2450  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.54 
 
 		 376 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0150  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.67 
 
 		 388 aa  49.7  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0778  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 414 aa  47.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12213  hitchhiker  0.000342475 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1598  GtrA family protein  23.48 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107787  normal  0.139272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4178  GtrA-like protein  29.2 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.476418  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2369  putative glycosyl transferase  29.5 
 
 		 376 aa  45.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 		 371 aa  45.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0656  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.26 
 
 		 339 aa  44.7  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.737559 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.67 
 
 		 345 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0022  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 412 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.19 
 
 		 384 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  25.68 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  30.37 
 
 		 145 aa  42  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 		 386 aa  41.6  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  24.48 
 
 		 186 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3088  GtrA family protein  32.61 
 
 		 703 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3936  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.57 
 
 		 397 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368189  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3189  GtrA family protein  32.61 
 
 		 703 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0515791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>