58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1297 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  99.56 
 
 
229 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  76.52 
 
 
272 aa  356  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  82.97 
 
 
227 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  78.79 
 
 
240 aa  350  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  63.06 
 
 
186 aa  214  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  58.54 
 
 
180 aa  208  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  56.89 
 
 
194 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  59.04 
 
 
186 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  55.15 
 
 
184 aa  198  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  56.36 
 
 
171 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  48.8 
 
 
200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  40.97 
 
 
206 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  40.74 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  38.67 
 
 
267 aa  93.2  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  30.16 
 
 
202 aa  92  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  37.06 
 
 
166 aa  88.2  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  34.06 
 
 
163 aa  85.5  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  36.5 
 
 
180 aa  85.1  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  32.65 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  34.52 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  36.03 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  37.06 
 
 
165 aa  82  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  34.39 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  36.3 
 
 
190 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  35.07 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  35.48 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  30.22 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  36.24 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  35 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  34.03 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  39.05 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  32.47 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  32.09 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  30.67 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  28.48 
 
 
188 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  30.2 
 
 
160 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  33.33 
 
 
165 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  28.49 
 
 
184 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  26.32 
 
 
147 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0464  GtrA-like protein  28.97 
 
 
176 aa  52  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611828  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  31.65 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  28.87 
 
 
194 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  28.97 
 
 
192 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  26.03 
 
 
143 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  28.48 
 
 
151 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  28.15 
 
 
124 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  30.34 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  29.47 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  34.41 
 
 
129 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
496 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1833  hypothetical protein  29.63 
 
 
159 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  26.09 
 
 
125 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  37.31 
 
 
131 aa  42.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3936  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31 
 
 
397 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368189  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  32.32 
 
 
146 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  26.09 
 
 
435 aa  41.6  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>