60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1869 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  64.12 
 
 		 180 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  63.16 
 
 		 166 aa  180  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  56.39 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  43.4 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  42.22 
 
 		 206 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  44.76 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  37.88 
 
 		 202 aa  96.7  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  37.24 
 
 		 188 aa  96.3  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  40.74 
 
 		 267 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  36.43 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  44.6 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  33.08 
 
 		 192 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  40 
 
 		 267 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  39.53 
 
 		 220 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  40 
 
 		 191 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  38.24 
 
 		 169 aa  87.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  35.62 
 
 		 190 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  31.68 
 
 		 184 aa  84  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  32.53 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  37.86 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  35.14 
 
 		 227 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  32 
 
 		 186 aa  80.5  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  36.49 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  35 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  35.77 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  35 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  35 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  34.93 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  38.46 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  34.51 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  33.58 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  31.72 
 
 		 272 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  35.62 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  35.57 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  29.03 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  32.33 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  30.67 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  32.35 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  30.28 
 
 		 213 aa  63.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  29.05 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  29.86 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  31.78 
 
 		 230 aa  57.4  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  31.01 
 
 		 231 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  26.8 
 
 		 194 aa  50.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  40.28 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  34.67 
 
 		 142 aa  47.4  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  28.57 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  31.5 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2056  GtrA family protein  26.56 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0085  GtrA family protein  26.56 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  38.33 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0022  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 412 aa  44.7  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  36.25 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  36.67 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  34.52 
 
 		 146 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  25.77 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  32 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  29.5 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  30.95 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>