26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02789 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  270  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1862  hypothetical protein  36.36 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548626  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  36.96 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  36.89 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  32.26 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  28.35 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  31.86 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4249  GtrA family protein  36.89 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000330424  unclonable  0.0000000113539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  39.13 
 
 		 267 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  31.45 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  32.28 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  44.07 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  42.37 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  30.08 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  36.23 
 
 		 267 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  37.84 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1007  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 407 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.034979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  33.33 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3627  GtrA family protein  28.7 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  36.25 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  22.66 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  28.23 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  32.52 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.46 
 
 		 345 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  25.71 
 
 		 200 aa  40.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  37.5 
 
 		 121 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>