20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4249 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4249  GtrA family protein  100 
 
 		 142 aa  280  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000330424  unclonable  0.0000000113539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  70.42 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3627  GtrA family protein  40.37 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1862  hypothetical protein  36.67 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548626  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  36.89 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  37.69 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  30.53 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  33.33 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  35.71 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  30.34 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5257  GtrA family protein  33.33 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.423271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  28.12 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  34.15 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  31.54 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  44.07 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  31.54 
 
 		 135 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  28.85 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  30.5 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  37.5 
 
 		 267 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  38.1 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>