25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5438 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  100 
 
 		 125 aa  241  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  31.71 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  33.06 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  35.71 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  34.92 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0085  GtrA family protein  27.87 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2056  GtrA family protein  27.87 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4249  GtrA family protein  36.92 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000330424  unclonable  0.0000000113539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  34.15 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  31.86 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1862  hypothetical protein  30.09 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548626  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  34.15 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  32 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  29.55 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  32.09 
 
 		 180 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  31.5 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3627  GtrA family protein  30.63 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  33.33 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  31.33 
 
 		 139 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  31.33 
 
 		 139 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  31.33 
 
 		 139 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  28.57 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  30.23 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4236  GtrA-like protein  26.4 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  32.61 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>