18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0405 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  100 
 
 
191 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  46.15 
 
 
146 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  29.77 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  37.21 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0085  GtrA family protein  31.54 
 
 
149 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2056  GtrA family protein  31.54 
 
 
149 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  27.56 
 
 
129 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  29.79 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  32 
 
 
125 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  34.43 
 
 
127 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  30.08 
 
 
134 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1645  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.28 
 
 
377 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  30.08 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5297  putative dolichol-phosphate mannosyltransferase  33.07 
 
 
377 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0151014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  30.14 
 
 
148 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
386 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0526  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.16 
 
 
340 aa  42  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  29.03 
 
 
145 aa  41.2  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.266635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>