23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0550 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  100 
 
 		 127 aa  248  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  46.83 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  43.55 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  40.48 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  42.86 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  42.62 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  36.8 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  43.44 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  33.6 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0085  GtrA family protein  29.27 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2056  GtrA family protein  29.27 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  32.26 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1862  hypothetical protein  33.87 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548626  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  31.85 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  34.43 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16020  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000816114  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3088  GtrA family protein  32.38 
 
 		 703 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3189  GtrA family protein  32.38 
 
 		 703 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0515791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  35.96 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01410  predicted membrane protein  33.68 
 
 		 150 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  32.93 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2450  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.28 
 
 		 376 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  31.06 
 
 		 142 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>