15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1862 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1862  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  266  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548626  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4249  GtrA family protein  36.67 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000330424  unclonable  0.0000000113539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  34.68 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  30.09 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0085  GtrA family protein  28.4 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2056  GtrA family protein  28.4 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  28.99 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3627  GtrA family protein  31.13 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  27.54 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  40.35 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  25.71 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  24.8 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  30 
 
 		 267 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>