55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0860 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  83.52 
 
 		 267 aa  441  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  46.54 
 
 		 160 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  47.02 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  42.05 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  44.3 
 
 		 155 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  43.71 
 
 		 191 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  46.88 
 
 		 162 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  44.37 
 
 		 190 aa  121  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  41.67 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  46.1 
 
 		 163 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  41.01 
 
 		 182 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  46.04 
 
 		 165 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  45.19 
 
 		 169 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  45.75 
 
 		 231 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  43.14 
 
 		 166 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  44.44 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  42.86 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  43.51 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  41.98 
 
 		 147 aa  99  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  38.06 
 
 		 200 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  40.82 
 
 		 171 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  42.96 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  40.74 
 
 		 229 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  40.74 
 
 		 229 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  40.4 
 
 		 186 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  40.74 
 
 		 229 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  40.74 
 
 		 158 aa  93.2  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  39.26 
 
 		 227 aa  92  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  39.04 
 
 		 169 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  40 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  37.78 
 
 		 202 aa  90.5  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  36 
 
 		 184 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  35.29 
 
 		 188 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  37.23 
 
 		 151 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  37.31 
 
 		 180 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  46.94 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  32.18 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  34.56 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  35.33 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  36.57 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  32.89 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  36.55 
 
 		 165 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  32.09 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  29.05 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  31.87 
 
 		 178 aa  57  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  32.53 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  39.13 
 
 		 134 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  37.88 
 
 		 142 aa  48.9  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1645  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.11 
 
 		 377 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  29.82 
 
 		 147 aa  45.4  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3189  GtrA family protein  29.25 
 
 		 703 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0515791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  25.68 
 
 		 143 aa  43.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  26.03 
 
 		 155 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  29.46 
 
 		 121 aa  42  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>