54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05020 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  100 
 
 		 171 aa  341  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  60.34 
 
 		 180 aa  222  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  62.89 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  56.36 
 
 		 229 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  56.36 
 
 		 229 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  56.36 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  55.15 
 
 		 227 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  53.94 
 
 		 272 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  53.94 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  54.55 
 
 		 240 aa  176  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  48.41 
 
 		 200 aa  157  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  46.88 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  44.64 
 
 		 194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  40.82 
 
 		 267 aa  96.7  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  38.04 
 
 		 267 aa  91.7  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  36.36 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  32.52 
 
 		 202 aa  89  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  34.59 
 
 		 220 aa  85.1  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  41.3 
 
 		 191 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  31.55 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  39.01 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  34.69 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  35.66 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  33.74 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  35.57 
 
 		 155 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  37.04 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  31.88 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  34.78 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  32.9 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  37.78 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  35.1 
 
 		 230 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  29.03 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  30.06 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  33.58 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  31.45 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  31.01 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  35.85 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  36.5 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  31.71 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  32.64 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  29.86 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  30.72 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  31.91 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  25.74 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  27.59 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3257  GtrA family protein  30 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.544135  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  25.52 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  29.45 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  25.33 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  30.15 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  37.68 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  34.55 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  30.83 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3627  GtrA family protein  30.58 
 
 		 116 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>