32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2875 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  100 
 
 		 160 aa  317  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  31.45 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5626  GtrA family protein  26.77 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  30.38 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  28.24 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  28.24 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  28.24 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  19.35 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3257  GtrA family protein  32.03 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.544135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  30.21 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  31.62 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  24.19 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  29.23 
 
 		 194 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  25.21 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  31.62 
 
 		 186 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0277  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25 
 
 		 373 aa  44.3  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0147732  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0267  GtrA family protein  28.3 
 
 		 170 aa  43.9  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  30.15 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1179  GtrA family protein  23.08 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  31.01 
 
 		 146 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  21.43 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  22.4 
 
 		 137 aa  42  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  22.58 
 
 		 127 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  22.58 
 
 		 127 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3088  GtrA family protein  26.51 
 
 		 703 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  22.58 
 
 		 127 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  24.59 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0836532  normal  0.23815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  29.75 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  29.75 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  29.75 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  29.75 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>