16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0052 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  100 
 
 
139 aa  279  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  100 
 
 
139 aa  279  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  100 
 
 
139 aa  279  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  100 
 
 
139 aa  279  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  34.48 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  35.04 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  28.93 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  35.43 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  35.43 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  30.77 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  27.64 
 
 
143 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  29.84 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1489  GtrA family protein  31.36 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  30.17 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  34.21 
 
 
151 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  29.75 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>