23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5626 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5626  GtrA family protein  100 
 
 		 131 aa  260  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1179  GtrA family protein  90.7 
 
 		 133 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  80.62 
 
 		 139 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  80.62 
 
 		 139 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  80.62 
 
 		 139 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  67.5 
 
 		 121 aa  163  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0267  GtrA family protein  54.41 
 
 		 170 aa  127  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  54.07 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01410  predicted membrane protein  48.46 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3931  GtrA family protein  31 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26697  normal  0.166614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  26.77 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2747  GtrA family protein  28.06 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  31.76 
 
 		 200 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  33.33 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  22.55 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  29.41 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6498  GtrA family protein  28.81 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129546  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  24.18 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2360  GtrA-like protein  25.21 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2019  GtrA family protein  35.19 
 
 		 140 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.781092  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  25.22 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2286  GtrA family protein  32.93 
 
 		 133 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>