28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0862 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  100 
 
 		 123 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1308  GtrA family protein  45.69 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000535922  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0660  bactoprenol-linked glucose translocase  47.41 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.89521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0725  bactoprenol-linked glucose translocase  47.41 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.58394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0669  bactoprenol-linked glucose translocase  47.41 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0604  bactoprenol-linked glucose translocase  46.55 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0609  bactoprenol-linked glucose translocase  46.55 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.268002 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0126  GtrA family protein  46.09 
 
 		 119 aa  103  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0656  bactoprenol-linked glucose translocase  46.9 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0416  bactoprenol-linked glucose translocase  46.9 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.966976  hitchhiker  0.000337924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4459  bactoprenol-linked glucose translocase  48.28 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4544  bactoprenol-linked glucose translocase  48.28 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4543  bactoprenol-linked glucose translocase  48.28 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663677  normal  0.189983 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2750  bactoprenol-linked glucose transferase  41.88 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.063262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0641  bactoprenol-linked glucose translocase (flippase)  42.11 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  35 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  35.16 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4236  GtrA-like protein  35.04 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  35.05 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  27.93 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2056  GtrA family protein  29.69 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0085  GtrA family protein  29.69 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5626  GtrA family protein  29.41 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  32.86 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0658  GtrA-like protein  40.28 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  24 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  24 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  24 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>