17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0669 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0660  bactoprenol-linked glucose translocase  100 
 
 
120 aa  243  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.89521  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0669  bactoprenol-linked glucose translocase  100 
 
 
120 aa  243  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0725  bactoprenol-linked glucose translocase  100 
 
 
120 aa  243  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.58394 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0609  bactoprenol-linked glucose translocase  99.17 
 
 
120 aa  243  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.268002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0604  bactoprenol-linked glucose translocase  99.17 
 
 
120 aa  243  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0656  bactoprenol-linked glucose translocase  93.33 
 
 
120 aa  235  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0416  bactoprenol-linked glucose translocase  93.33 
 
 
120 aa  235  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.966976  hitchhiker  0.000337924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2750  bactoprenol-linked glucose transferase  85 
 
 
129 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.063262  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1308  GtrA family protein  81.67 
 
 
120 aa  209  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000535922  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4544  bactoprenol-linked glucose translocase  70.83 
 
 
120 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4543  bactoprenol-linked glucose translocase  70.83 
 
 
120 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663677  normal  0.189983 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4459  bactoprenol-linked glucose translocase  70.83 
 
 
120 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0126  GtrA family protein  57.63 
 
 
119 aa  142  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0641  bactoprenol-linked glucose translocase (flippase)  55.93 
 
 
118 aa  134  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  47.41 
 
 
123 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1387  GtrA family protein  28.17 
 
 
145 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  32.2 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>