15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2750 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2750  bactoprenol-linked glucose transferase  100 
 
 
129 aa  266  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.063262  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0416  bactoprenol-linked glucose translocase  88.98 
 
 
120 aa  219  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.966976  hitchhiker  0.000337924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0656  bactoprenol-linked glucose translocase  88.98 
 
 
120 aa  219  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0609  bactoprenol-linked glucose translocase  85.83 
 
 
120 aa  217  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.268002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0604  bactoprenol-linked glucose translocase  85.83 
 
 
120 aa  217  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0669  bactoprenol-linked glucose translocase  85 
 
 
120 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0725  bactoprenol-linked glucose translocase  85 
 
 
120 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.58394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0660  bactoprenol-linked glucose translocase  85 
 
 
120 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.89521  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1308  GtrA family protein  72.5 
 
 
120 aa  190  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000535922  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4544  bactoprenol-linked glucose translocase  63.33 
 
 
120 aa  171  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4543  bactoprenol-linked glucose translocase  63.33 
 
 
120 aa  171  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663677  normal  0.189983 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4459  bactoprenol-linked glucose translocase  63.33 
 
 
120 aa  171  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0126  GtrA family protein  56.3 
 
 
119 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0641  bactoprenol-linked glucose translocase (flippase)  50.85 
 
 
118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  41.88 
 
 
123 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
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