29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0658 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0658  GtrA-like protein  100 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  66.4 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  66.39 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  49.59 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2257  GtrA-like protein  49.57 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155693  normal  0.0540775 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  51.28 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  50.43 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  50.43 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  50.43 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  50.43 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  50.43 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  50.43 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3840  GtrA family protein  48.72 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0764711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3686  GtrA family protein  48.72 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104417  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4524  GtrA-like protein  48.72 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  46.61 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5987  GtrA family protein  45.76 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7211  hypothetical protein  48.72 
 
 		 129 aa  97.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.778589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  44.44 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  38.32 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  29.01 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  30.08 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0641  bactoprenol-linked glucose translocase (flippase)  36.11 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  34.96 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  23.73 
 
 		 139 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  30.95 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2009  hypothetical protein  26.89 
 
 		 128 aa  40  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  32.43 
 
 		 191 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>