35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5509 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  100 
 
 		 127 aa  248  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  100 
 
 		 127 aa  248  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  96.85 
 
 		 127 aa  240  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7211  hypothetical protein  83.46 
 
 		 129 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.778589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  73.23 
 
 		 127 aa  190  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5987  GtrA family protein  73.23 
 
 		 127 aa  189  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2257  GtrA-like protein  64.52 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155693  normal  0.0540775 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3686  GtrA family protein  63.2 
 
 		 128 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104417  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4524  GtrA-like protein  63.2 
 
 		 128 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3840  GtrA family protein  63.2 
 
 		 128 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0764711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  55.46 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  52.1 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  52.1 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  52.1 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  47.86 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  44.44 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0658  GtrA-like protein  50.43 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  44.44 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  41.41 
 
 		 129 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  31.71 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  24.06 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0641  bactoprenol-linked glucose translocase (flippase)  29.79 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  26.19 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  29.27 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  34.33 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2747  GtrA family protein  36.36 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  23.2 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1247  GtrA-like protein  31.2 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  26.02 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  26.02 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  43.64 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  27.5 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  26.02 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  34.48 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  31.25 
 
 		 146 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>