39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2634 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  100 
 
 
129 aa  259  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  51.28 
 
 
121 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  48.39 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  47.01 
 
 
128 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  45.61 
 
 
120 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  44.44 
 
 
128 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  44.44 
 
 
128 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  44.44 
 
 
128 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  42.19 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0658  GtrA-like protein  49.59 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  41.41 
 
 
127 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  41.41 
 
 
127 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2257  GtrA-like protein  39.84 
 
 
128 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155693  normal  0.0540775 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7211  hypothetical protein  40.83 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.778589  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4524  GtrA-like protein  40.83 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3686  GtrA family protein  40.83 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104417  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3840  GtrA family protein  40.83 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0764711  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5987  GtrA family protein  40 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  40 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  28.57 
 
 
173 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  30 
 
 
133 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  34.31 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  34.31 
 
 
227 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  30.34 
 
 
200 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  34.41 
 
 
229 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  34.41 
 
 
229 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  34.41 
 
 
229 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  27.5 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  27.5 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  26.23 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  30.95 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  34.48 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  26.4 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0562  GtrA family protein  38.18 
 
 
140 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  34.09 
 
 
272 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  24.59 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0598  GtrA family protein  28.33 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2757  GtrA-like protein  25.4 
 
 
130 aa  40  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.889117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1247  GtrA-like protein  31.36 
 
 
128 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>