12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0598 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0598  GtrA family protein  100 
 
 		 134 aa  261  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0562  GtrA family protein  69.29 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1376  GtrA-like protein  43.97 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000381403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  36.21 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0770  GtrA-like protein  40.52 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2757  GtrA-like protein  39.69 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.889117 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  33.6 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1525  GtrA family protein  37.62 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  34.88 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1247  GtrA-like protein  35.59 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226079  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  28.33 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  31.67 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>