31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4289 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  100 
 
 		 170 aa  343  8e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  100 
 
 		 170 aa  343  8e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1489  GtrA family protein  37.01 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658606 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  41.67 
 
 		 131 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  39.34 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5967  bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA  39.5 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360184  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1750  GtrA family protein  39.5 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  37.5 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  34.45 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  38.52 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  36.97 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0289  GtrA family protein  29.93 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  32.79 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8840  GtrA family protein  30.71 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  31.15 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  37.7 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  35.43 
 
 		 139 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  35.43 
 
 		 139 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  35.43 
 
 		 139 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  35.43 
 
 		 139 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  21.21 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2814  GtrA family protein  42.86 
 
 		 125 aa  48.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  23.81 
 
 		 127 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  23.81 
 
 		 127 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  23.81 
 
 		 127 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  23.58 
 
 		 127 aa  44.7  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  27.08 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  27.5 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1391  GtrA family protein  22.83 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 460 aa  41.2  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2019  GtrA family protein  28.33 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.781092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>