29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0538 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  100 
 
 		 142 aa  280  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  85.95 
 
 		 121 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0658  GtrA-like protein  66.4 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  48.39 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  50.41 
 
 		 128 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  50.4 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  50.4 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  50.4 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  48.72 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2257  GtrA-like protein  47.86 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155693  normal  0.0540775 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  47.86 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  47.86 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4524  GtrA-like protein  47.86 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3840  GtrA family protein  47.86 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0764711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3686  GtrA family protein  47.86 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104417  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7211  hypothetical protein  47.86 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.778589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  42.37 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  42.5 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5987  GtrA family protein  41.53 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  32.56 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  24.58 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  35 
 
 		 127 aa  47.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  35.05 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  25 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1750  GtrA family protein  38.3 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5967  bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA  38.3 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360184  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  33.33 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  34.34 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  27.82 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>