30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6129 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  100 
 
 		 127 aa  245  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5967  bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA  56.69 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360184  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1750  GtrA family protein  56.69 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1489  GtrA family protein  45.45 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658606 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  43.8 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  39.34 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  39.34 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  40 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  35.29 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  35.04 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  30.4 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  35.04 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  35.04 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  35.04 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  23.73 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  32.23 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  25.2 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  25.2 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  25.81 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  25.2 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0289  GtrA family protein  34.17 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  35 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  28.57 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  32.81 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  26.23 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5539  hypothetical protein  38.26 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173493  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  26.15 
 
 		 173 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  35.4 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  27.35 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0497  hypothetical protein  29.49 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.731472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>