31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6382 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  100 
 
 
127 aa  247  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  96.85 
 
 
127 aa  240  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  96.85 
 
 
127 aa  240  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7211  hypothetical protein  85.83 
 
 
129 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.778589  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  72.44 
 
 
127 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5987  GtrA family protein  72.44 
 
 
127 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2257  GtrA-like protein  64.52 
 
 
128 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155693  normal  0.0540775 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3840  GtrA family protein  63.2 
 
 
128 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0764711  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4524  GtrA-like protein  63.2 
 
 
128 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3686  GtrA family protein  63.2 
 
 
128 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104417  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  54.62 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  51.26 
 
 
128 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  51.26 
 
 
128 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  51.26 
 
 
128 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  48.72 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  45.3 
 
 
121 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0658  GtrA-like protein  50.43 
 
 
148 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  42.19 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  44.44 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  30.89 
 
 
221 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  29.27 
 
 
169 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  25.2 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  25.2 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2747  GtrA family protein  38.98 
 
 
129 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  25.2 
 
 
127 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  32.84 
 
 
129 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  27.05 
 
 
127 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0641  bactoprenol-linked glucose translocase (flippase)  34.72 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1247  GtrA-like protein  31.2 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  24 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  29.84 
 
 
173 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>