45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0058 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  100 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  52.94 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  50 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2814  GtrA family protein  49.59 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  47.93 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  38.14 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  31.45 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  31.78 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  26.4 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  32.79 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  32.79 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  29.35 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  24.22 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  29.35 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  29.35 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  35.29 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  26.26 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5967  bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA  41 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360184  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1750  GtrA family protein  41 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  30 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  24.59 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0289  GtrA family protein  31.67 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2498  GtrA family protein  30.08 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1598  GtrA family protein  25 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107787  normal  0.139272 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1391  GtrA family protein  29.47 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  27.43 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3623  GtrA family protein  29.13 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  28.33 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1525  GtrA family protein  29.29 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  33.64 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  28.93 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  30.17 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1489  GtrA family protein  25.81 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658606 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0338  GtrA family protein  29.06 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.318584  normal  0.128755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  30.17 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  30.17 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  30.17 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  26.89 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3509  GtrA family protein  33.33 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0058  GtrA family protein  27.01 
 
 		 143 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  25.86 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1553  hypothetical protein  30.66 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  32.35 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1376  GtrA-like protein  31.67 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000381403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>