18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1391 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1391  GtrA family protein  100 
 
 
97 aa  187  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  38.95 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0349  GtrA family protein  35.11 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.907419  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  37.36 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  34.88 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  36.26 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  32.26 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  36.26 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  36.26 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  34.78 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  29.47 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3257  GtrA family protein  26.8 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.544135  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  22.83 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2019  GtrA family protein  36.46 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.781092  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  22.83 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  33.33 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  32.97 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  32.18 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>