48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2019 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2019  GtrA family protein  100 
 
 
140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.781092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2875  GtrA family protein  58.91 
 
 
135 aa  140  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2360  GtrA-like protein  51.16 
 
 
130 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244364 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  38.1 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  31.5 
 
 
139 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  42.61 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3623  GtrA family protein  37.69 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  38.02 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  31.5 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  31.5 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  31.5 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  33.33 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  35.07 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  34.04 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  31.15 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1391  GtrA family protein  35.42 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18800  GtrA family protein  29.77 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000044791  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  28.33 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.67 
 
 
345 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  28.33 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  33.83 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  28.68 
 
 
202 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2747  GtrA family protein  28.57 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4236  GtrA-like protein  30.83 
 
 
176 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  30.51 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1179  GtrA family protein  34.25 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  38.89 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  38.89 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  38.89 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  29.77 
 
 
267 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  28.06 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  27.73 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  26.81 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.81 
 
 
371 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  28.89 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  33.78 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2009  hypothetical protein  26.43 
 
 
128 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5626  GtrA family protein  35.19 
 
 
131 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558641  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  33.67 
 
 
192 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  31.06 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  34.41 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  36.36 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0349  GtrA family protein  23.53 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.907419  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  27.96 
 
 
190 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  34.67 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
340 aa  40.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0778  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
414 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12213  hitchhiker  0.000342475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  29.71 
 
 
146 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>