55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1743 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  36.99 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  34.69 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  31.39 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0245  GtrA family protein  33.56 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.322541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  34.62 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  30.83 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2875  GtrA family protein  33.08 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  35.07 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  33.33 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  28.79 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  31.62 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3623  GtrA family protein  29.77 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  29.05 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1299  GtrA-like protein  30.43 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2450  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.89 
 
 		 376 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  33.33 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  25.97 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2360  GtrA-like protein  36.36 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  26.87 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  32.86 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  32.86 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  32.86 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  30.77 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  29.79 
 
 		 191 aa  47.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  30 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  29.55 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0747  GtrA family protein  27.82 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.78 
 
 		 371 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  29.93 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  28.78 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  22.88 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  30.21 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  22.88 
 
 		 227 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  28.24 
 
 		 220 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  26 
 
 		 152 aa  43.9  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  25.33 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  25.9 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  31.43 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  22.96 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  29.85 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  28.26 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  23.33 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  27.88 
 
 		 184 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  26.03 
 
 		 267 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18800  GtrA family protein  32.58 
 
 		 130 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000044791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  26.95 
 
 		 191 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2019  GtrA family protein  41.89 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.781092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  25.36 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  28.15 
 
 		 267 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  30.95 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  23.57 
 
 		 272 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  23.45 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>