60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3935 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  100 
 
 		 163 aa  327  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  52.83 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  53.42 
 
 		 206 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  53.9 
 
 		 220 aa  153  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  55.07 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  55.32 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  53.9 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  45.95 
 
 		 190 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  46.9 
 
 		 191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  45.93 
 
 		 220 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  47.89 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  47.48 
 
 		 169 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  45.58 
 
 		 267 aa  120  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  47.92 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  43.45 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  43.84 
 
 		 267 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  42.33 
 
 		 221 aa  110  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  40.26 
 
 		 188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  50 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  40.28 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  35.46 
 
 		 227 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  36.69 
 
 		 147 aa  94.4  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  35.46 
 
 		 240 aa  94  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  37.34 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  36.36 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  34.32 
 
 		 186 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  40 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  35.37 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  39.72 
 
 		 230 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  33.12 
 
 		 229 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  33.12 
 
 		 229 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  33.12 
 
 		 229 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  31.91 
 
 		 272 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  34.75 
 
 		 180 aa  87  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  36.36 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  35.71 
 
 		 184 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  38.24 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  30.71 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  30.5 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  33.12 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  35.95 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  38.19 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  31.91 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  36.96 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  29.17 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  31.68 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  32.67 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  32.98 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  29.32 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  29.14 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3936  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.5 
 
 		 397 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368189  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4249  GtrA family protein  36.25 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000330424  unclonable  0.0000000113539 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  31.13 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  32.59 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  31.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2498  GtrA family protein  32.28 
 
 		 150 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  32.95 
 
 		 191 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1911  GtrA family protein  26.39 
 
 		 419 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0238992 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  35.79 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>