44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3505 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  47.06 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  33.08 
 
 		 158 aa  90.1  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  35.82 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  35.82 
 
 		 180 aa  85.5  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  33.12 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  28.26 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  34.78 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  32.87 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  30.93 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  31.16 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  37.37 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  28.85 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  30.83 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  31.21 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  23.37 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  31.91 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  29.05 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  27.4 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  31.43 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  29.08 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  29.66 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  31.87 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  26.95 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  30.49 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  29.88 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  26.84 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  31.11 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  25.53 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  26.71 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  27.21 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  27.86 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  29.66 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  27.66 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  28.97 
 
 		 229 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  28.97 
 
 		 229 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  28.97 
 
 		 229 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  24.18 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  28.68 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  24.16 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  25.52 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  26.24 
 
 		 151 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  23.36 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  23.57 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>