51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4358 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  100 
 
 		 151 aa  298  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  44.09 
 
 		 220 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  41.61 
 
 		 190 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  38.03 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  40 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  42.75 
 
 		 165 aa  99.4  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  37.5 
 
 		 221 aa  98.6  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  39.16 
 
 		 206 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  40.79 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  37.84 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  40.15 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  38.58 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  36.57 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  34.81 
 
 		 267 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  35 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  38.28 
 
 		 231 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  38.69 
 
 		 184 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  38.28 
 
 		 230 aa  77  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  34.56 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  33.85 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  34.85 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  36.03 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  34.51 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  34.62 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  29.88 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  33.09 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  30.77 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  34.78 
 
 		 220 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  32.47 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  31.03 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  28.95 
 
 		 272 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  33.33 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  30.28 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  28.48 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  28.48 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  28.48 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  28.68 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  26.58 
 
 		 227 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  31.88 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  22.66 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  26.97 
 
 		 240 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  30.14 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  24.36 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  27.41 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  27.21 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 		 416 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  25.53 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  31.51 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  31.52 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  27.59 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>