55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2548 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  308  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  55.48 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  48.92 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  46.85 
 
 		 220 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  45.51 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  44.3 
 
 		 267 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  48.85 
 
 		 191 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  46.9 
 
 		 267 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  46.62 
 
 		 206 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  43.17 
 
 		 190 aa  120  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  47.06 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  43.57 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  44.03 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  41.18 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  36.88 
 
 		 202 aa  99.8  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  40.43 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  38.93 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  40 
 
 		 220 aa  89  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  38.52 
 
 		 180 aa  88.6  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  47.92 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  38.46 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  35.57 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  36.73 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  36.49 
 
 		 230 aa  77  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  29.3 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  38.51 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  34.01 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  31.58 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  33.11 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  34.93 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  32.08 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  32.87 
 
 		 192 aa  73.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  34.53 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  32.47 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  32.47 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  32.47 
 
 		 229 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  31.82 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  30.67 
 
 		 240 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  34.85 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  31.88 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  27.7 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  36.43 
 
 		 184 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  28.28 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  33.33 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  26.11 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  23.24 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  26.53 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  31.85 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  22.79 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  25.35 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  30.34 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  27.61 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  19.85 
 
 		 127 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  19.85 
 
 		 127 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>