21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1553 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1553  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  283  7e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0167  hypothetical protein  65.62 
 
 		 141 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.319127  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0892  hypothetical protein  63.85 
 
 		 141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3790  hypothetical protein  63.08 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0058  GtrA family protein  59.7 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0326  hypothetical protein  58.02 
 
 		 133 aa  153  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0141  GtrA family protein  49.62 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1704  GtrA-like protein  45.24 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  40.16 
 
 		 631 aa  97.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3488  GtrA family protein  34.56 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3164  GtrA family protein  34.56 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3360  GtrA family protein  34.75 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5947  hypothetical protein  30.83 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  37.33 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2429  GtrA family protein  24.32 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.859714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  29.01 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  29.01 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  29.01 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3931  GtrA family protein  34.85 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26697  normal  0.166614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  40 
 
 		 146 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  30.66 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>