18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0892 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0892  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3790  hypothetical protein  90.07 
 
 
141 aa  257  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0167  hypothetical protein  80.14 
 
 
141 aa  235  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.319127  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0058  GtrA family protein  60.77 
 
 
143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1553  hypothetical protein  63.85 
 
 
143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0326  hypothetical protein  55.81 
 
 
133 aa  159  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0141  GtrA family protein  47.37 
 
 
141 aa  124  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  43.75 
 
 
631 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1704  GtrA-like protein  42.19 
 
 
129 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5947  hypothetical protein  36.3 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3488  GtrA family protein  35.94 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3164  GtrA family protein  35.94 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3360  GtrA family protein  32.8 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2429  GtrA family protein  24.16 
 
 
194 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.859714  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  35.14 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5592  hypothetical protein  31.96 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.586213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5008  GtrA family protein  25.5 
 
 
162 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1217  hypothetical protein  20.16 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>