15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0141 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0141  GtrA family protein  100 
 
 		 141 aa  279  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0167  hypothetical protein  51.49 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.319127  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0892  hypothetical protein  47.37 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3790  hypothetical protein  48.51 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1553  hypothetical protein  49.62 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0326  hypothetical protein  48.48 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0058  GtrA family protein  48.06 
 
 		 143 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1704  GtrA-like protein  46.51 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  39.68 
 
 		 631 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3164  GtrA family protein  34.68 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3488  GtrA family protein  34.68 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5947  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2429  GtrA family protein  23.45 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.859714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5008  GtrA family protein  31.69 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3360  GtrA family protein  34.88 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>