16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3164 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3164  GtrA family protein  100 
 
 		 141 aa  271  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3488  GtrA family protein  98.58 
 
 		 141 aa  266  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3360  GtrA family protein  72.66 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5592  hypothetical protein  48.8 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.586213  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1704  GtrA-like protein  36.92 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0058  GtrA family protein  36.69 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3790  hypothetical protein  35.71 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0892  hypothetical protein  35.94 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0141  GtrA family protein  34.68 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0167  hypothetical protein  35.16 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.319127  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0326  hypothetical protein  34.59 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1553  hypothetical protein  34.56 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  32.59 
 
 		 631 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5008  GtrA family protein  24.48 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5947  hypothetical protein  27.5 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5463  GtrA family protein  35.71 
 
 		 137 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>