18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0167 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0167  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  280  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.319127  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3790  hypothetical protein  81.56 
 
 		 141 aa  236  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0892  hypothetical protein  80.14 
 
 		 141 aa  235  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0326  hypothetical protein  60.47 
 
 		 133 aa  168  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0058  GtrA family protein  63.85 
 
 		 143 aa  166  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1553  hypothetical protein  65.62 
 
 		 143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0141  GtrA family protein  51.49 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  42.97 
 
 		 631 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1704  GtrA-like protein  42.19 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5947  hypothetical protein  32.59 
 
 		 163 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3488  GtrA family protein  35.16 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3164  GtrA family protein  35.16 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3360  GtrA family protein  31.78 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2429  GtrA family protein  25 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.859714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5592  hypothetical protein  34.12 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.586213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  28.97 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1217  hypothetical protein  23.08 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5008  GtrA family protein  26.9 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>