12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5008 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5008  GtrA family protein  100 
 
 		 162 aa  324  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2429  GtrA family protein  50.62 
 
 		 194 aa  156  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.859714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5947  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0141  GtrA family protein  31.69 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3488  GtrA family protein  25.17 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0167  hypothetical protein  26.9 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.319127  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3164  GtrA family protein  24.48 
 
 		 141 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  26.95 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0058  GtrA family protein  25.35 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0892  hypothetical protein  25.5 
 
 		 141 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3360  GtrA family protein  26.36 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3790  hypothetical protein  25 
 
 		 141 aa  40.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>