12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2429 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2429  GtrA family protein  100 
 
 		 194 aa  393  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.859714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5008  GtrA family protein  50.62 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5947  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0141  GtrA family protein  23.45 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0167  hypothetical protein  25 
 
 		 141 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.319127  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3790  hypothetical protein  25 
 
 		 141 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0892  hypothetical protein  24.16 
 
 		 141 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1553  hypothetical protein  24.32 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0326  hypothetical protein  22.76 
 
 		 133 aa  48.5  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0058  GtrA family protein  19.31 
 
 		 143 aa  44.7  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  23.02 
 
 		 631 aa  41.2  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3488  GtrA family protein  21.53 
 
 		 141 aa  41.2  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>