14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3360 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3360  GtrA family protein  100 
 
 		 144 aa  278  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3164  GtrA family protein  72.66 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3488  GtrA family protein  71.94 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5592  hypothetical protein  47.18 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.586213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0058  GtrA family protein  32.85 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1553  hypothetical protein  34.75 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3790  hypothetical protein  34.4 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0141  GtrA family protein  36.29 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0892  hypothetical protein  34.4 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0167  hypothetical protein  34.4 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.319127  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1704  GtrA-like protein  32.82 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0326  hypothetical protein  31.3 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  31.3 
 
 		 631 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5008  GtrA family protein  25.22 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>