15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1704 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1704  GtrA-like protein  100 
 
 		 129 aa  249  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0058  GtrA family protein  52.42 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1553  hypothetical protein  45.24 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0167  hypothetical protein  42.19 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.319127  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0141  GtrA family protein  46.51 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  41.41 
 
 		 631 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0892  hypothetical protein  42.19 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3790  hypothetical protein  41.41 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0326  hypothetical protein  40.16 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3488  GtrA family protein  36.92 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3164  GtrA family protein  36.92 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5947  hypothetical protein  29.92 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5592  hypothetical protein  33.85 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.586213  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3360  GtrA family protein  30.83 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  32.79 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>