16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1217 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1217  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  248  3e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3058  hypothetical protein  47.59 
 
 
159 aa  125  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1646  hypothetical protein  48.82 
 
 
133 aa  124  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2830  hypothetical protein  47.29 
 
 
141 aa  120  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0650774  normal  0.122889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6247  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0497  hypothetical protein  47.97 
 
 
142 aa  114  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.731472 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5789  hypothetical protein  49.61 
 
 
143 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598783  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3979  hypothetical protein  46.09 
 
 
135 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0267676  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2274  hypothetical protein  43.44 
 
 
137 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294695  normal  0.307449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2565  hypothetical protein  50.54 
 
 
99 aa  100  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2162  hypothetical protein  42.64 
 
 
154 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1028  hypothetical protein  40.8 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1832  hypothetical protein  39.58 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0167  hypothetical protein  23.08 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.319127  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3790  hypothetical protein  19.35 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0892  hypothetical protein  20.16 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>