39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2814 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2814  GtrA family protein  100 
 
 		 125 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  51.26 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  49.59 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  48.33 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  49.17 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  42.86 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  42.86 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  42.98 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  36 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  34.35 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  34.35 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  34.35 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  34.35 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  32.52 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  34.96 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1489  GtrA family protein  37.7 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1750  GtrA family protein  40.78 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5967  bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA  40.78 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360184  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  36 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  28.46 
 
 		 131 aa  48.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  33.64 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5539  hypothetical protein  40.68 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  28.1 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  29.84 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0289  GtrA family protein  34.17 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  25 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  27.12 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  21.95 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  27.05 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  25 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  23.14 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  32.73 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  27.87 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1598  GtrA family protein  25.62 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107787  normal  0.139272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  30.7 
 
 		 120 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  21.85 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2757  GtrA-like protein  35.94 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.889117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8840  GtrA family protein  35.44 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>