30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5539 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5539  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  227  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63720  hypothetical protein  85.83 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.031805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  41.38 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  29.31 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1489  GtrA family protein  37.5 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  34.75 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2814  GtrA family protein  40.68 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  32.77 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  32.77 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  32.77 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  32.77 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  34.45 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1750  GtrA family protein  38.3 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5967  bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA  38.3 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360184  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  33.91 
 
 		 159 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  33.9 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  34.78 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  35.9 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  35.9 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  40 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  23.77 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1626  GtrA family protein  26.27 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.944895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0512  GtrA family protein  34.75 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.858233  normal  0.0231289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  29.57 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  28.7 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  24.11 
 
 		 134 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  29.57 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  28.32 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1596  GtrA family protein  32.79 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00834941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0289  GtrA family protein  30.16 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>