25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1489 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1489  GtrA family protein  100 
 
 		 149 aa  297  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658606 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  69.53 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  45.45 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  37.01 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  37.01 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1750  GtrA family protein  42.61 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5967  bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA  42.61 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360184  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0289  GtrA family protein  29.66 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  34.68 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  35.34 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  26.45 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  35.14 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  26.67 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  26.67 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  26.67 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  32.95 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  28.81 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8840  GtrA family protein  29.03 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  31.36 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  31.36 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  31.36 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  31.36 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  25.81 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  21.54 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3623  GtrA family protein  27.94 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>