36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3635 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  100 
 
 
136 aa  262  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  45 
 
 
159 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  43.22 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  44.26 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  38.14 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  34.75 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  36.97 
 
 
170 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  36.97 
 
 
170 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  40 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  37.8 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  24.19 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2814  GtrA family protein  42.98 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  30.4 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1489  GtrA family protein  32.48 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0289  GtrA family protein  39.64 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5967  bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA  38.52 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360184  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1750  GtrA family protein  38.52 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  26.89 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  30.16 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  30.16 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  30.16 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  30.16 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  35.54 
 
 
142 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  28.68 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1598  GtrA family protein  28.47 
 
 
155 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107787  normal  0.139272 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2157  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  22.05 
 
 
386 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  23.14 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  22.22 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  24.17 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0747  GtrA family protein  29.69 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  22.22 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  22.22 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.57 
 
 
371 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3623  GtrA family protein  29.92 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  23.81 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2498  GtrA family protein  25.78 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>