19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8840 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8840  GtrA family protein  100 
 
 		 157 aa  315  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  32.17 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  32.17 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  27.04 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5257  GtrA family protein  31.97 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.423271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0150  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.57 
 
 		 388 aa  50.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  25.45 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  25.79 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1489  GtrA family protein  29.01 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  36.54 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  25.66 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  29.84 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14690  hypothetical protein  30.56 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0877793  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3095  GtrA family protein  31.33 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0522418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3224  glycosyltransferase  31.39 
 
 		 374 aa  44.3  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  26.38 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  30 
 
 		 190 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 460 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5297  putative dolichol-phosphate mannosyltransferase  32.91 
 
 		 377 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>